勝選後的馬英九，在未來的泛藍整合與二○○四年總統大選等議題上的角色，備受矚目。政治學者分析，在連、宋、馬的關係裡，以及在扁、馬的互動中，馬英九擁有更大的進退空間，但必須謹慎以對。

東海大學政治系教授王業立指出，面對二○○四年總統大選，連、宋、馬如何搭配，目前一些民調已對各種組合進行調查，目前連宋配還是獲較多選民支持，但比率並非很高，因此是否能贏過陳呂配仍是未知數。不過，連戰缺乏群眾魅力，再選一次總統，能否獲得民意高度支持，這是泛藍陣營必須思考的。另外，泛藍陣營也會有世代交替的壓力；國民黨過去有包袱重、缺乏改革決心、欠缺魅力型領導人物等缺點，但這反而是馬英九的利基，因此泛藍陣營在思考誰配誰時，世代交替壓力不可忽視。最後，目前看來國民黨在政治舞台的主控權還是較親民黨大，因此宋楚瑜要參選總統，而由國民黨候選人任副總統可能性不大。

中山大學政治所教授廖達琪則表示，未來不斷會有各種訊息湧出，力拱馬英九參選二○○四年的總統大選，但這種激情的期待對於馬英九本人，甚至對於泛藍陣營而言，並不實際。馬英九仍應回歸「本尊」，以台北市市政為優先，遵守對市民的承諾；至於連宋之間的恩怨情仇或泛藍陣營如何整合的問題，馬英九不如維持一致的調性，以「晚輩」身分看待連宋間的互動，不必過度涉入。

馬英九的勝選也牽扯到未來扁馬互動以及中央與地方關係的問題，廖達琪分析，以民進黨擅長操作選舉策略的性格，藉此提前開打總統大選不難想像，但馬英九在對待陳總統的角色上，仍應拿捏分寸，保持尊重的態度，並且不要對二○○四年的總統選舉過早表態，否則只會對自己不利。

王業立則認為，未來扁馬關係的發展，不太可能有舒緩的空間，馬英九面對中央時態度會更謹慎小心，但不太可能與中央密切合作，因為像統籌分配款這類爭議仍持續存在；而且依陳水扁的性格，中央和北市將會更緊張。不過，中央與地方的相處之道仍應回歸到制度面上，不應受政治人物性格的影響。

2002-12-09╱聯合報╱第04版╱政治╱記者郭乃日、蘇位榮╱台北報導