SARS的威力重創國內旅遊業，馬祖也受到嚴重波及。從四月起到暑假本是馬祖旅遊業的旺季，可是由於SARS疫情發燒，影響民眾出門的意願，使得到馬祖旅遊的人數大幅下滑，業者叫苦連天。

在馬祖旅遊業具有指標意義的南竿神農山莊，四月訂房取消的旅客高達六百人左右，神農山莊副總經理指出，五月的退房人數也已達一百人左右，損失十分慘重。

牛角村民宿業者也表示，原定五月到馬祖參訪的兩個師生團，日前已將行程延後。此外，詩人余光中應曹以雄議員邀請，原本預定五月到馬祖演講，也因為擔心搭乘飛機，而將行程展延到暑假。

北竿鄉的旅遊業者也一樣，最近旅社都紛紛收到觀光團取消行程的通知。北竿觀光勝地芹壁村與立榮航空合作推出的套裝旅遊行程，原本市場反應頗佳，但受到SARS疫情影響，近來遊客減少許多，業者手持一疊退房傳真函，大嘆生意難做。

據了解，馬祖地區目前並未發生SARS病例，但是由於媒體的傳播，以及馬祖宣布暫時關閉小三通，台灣民眾感覺馬祖在地理上很接近SARS疫情嚴重的中國大陸，誤以為馬祖是「危險地區」。

旅遊業者指出，雖然台灣SARS警報仍未解除，不過相較之下，馬祖因為環境單純、空氣流通，且少有密閉的公共場所，因此到馬祖旅遊應屬較安全的選擇。

2003-04-22╱聯合報╱第18版╱台北縣新聞╱記者岳青峰╱馬祖報導